面對上杉清定請求給自己次男小笠原長定出任官位、役職之事，朝廷方面完全沒有受到任何阻礙就一致通過。
畢竟，此時扶桑的首都已經從山城境內的京都遷至上杉家治下領國腹地的武藏豐島郡江戶城，完全就在上杉家的眼皮子底下生活，還有什么底氣敢拒絕？
再加上，眼下朝廷之中幸存下來的公卿以現任太政大臣近衛前久為首，皆為親上杉家一派，他們為了能讓自家的家名、莊園繼續傳承下去，自然是不會與上杉家唱反調的。
至于被上杉清定下令救出并踐祚登基的正親町天皇是更加對上杉家感恩戴德，甚至還有授予其國公之位，以及取代足利義氏成為武家棟梁的想法。
而足利義氏這邊也不打算讓清定白白辭任信濃守護職，并不希望足利將軍家的管領之職長期處于空缺的狀態，更不希望細川讃岐守家（阿波守護細川家）出身的細川晴元有任何過問政務的機會，便順勢將清定升任為管領。
管領，即執掌政務之意，職能就是協助征夷大將軍處理天下政務。
不僅如此，足利義氏還將隱岐、美作、備中、備后、安藝、周防、長門七國守護職與東山探題之職授予清定，仍讓其兼任關東管領、奧州管領、蝦夷管領、羽州管領、東海探題、北陸探題、御相伴眾、諸國守護（陸奧、陸中、陸前、津輕、羽前、羽后、巖代、磐城、越后、佐渡、越中、越前、能登、甲斐、下野、上野、常陸、下總、上總、安房、伊豆、駿河、飛驒、美濃、伊勢、尾張、志摩、近江、伊賀、若狹、山城、丹波、攝津、播磨、和泉、河內、淡路、于山、阿波、讃岐等）等職，并繼續享有七樣免許，家格、地位完全凌駕于副將軍細川晴元之上。
更為重要的一點，足利義氏效仿二代目室町殿足利義詮招降南朝方有力大名大內家、山名家那樣，直接將治下所領的分配權完全交給上杉家自行決定，絕不干涉上杉家治下所領之事。
如此一來，足利義氏此后不僅不會過問上杉家治下所領之事，更不會掣肘上杉家開疆拓土。
清定鑒于長男上杉氏定才元服不久，為了避免自己其他兒子們以后有著非分之想，打算效仿東漢光武帝劉秀那樣，讓諸王就藩，遠離朝堂核心，杜絕紛爭根源。
而且，清定讓兒子們就藩絕不是簡簡單單的進行“遣散本宗”，而是上杉家治世走向成熟的關鍵一步：
在政治層面，本宗離開上杉家本據小田原城能直接削弱他們在小田原城的勢力，避免“本宗爭權”、“宗室干政”的亂象，將權力高度集中于家督之手，為后續平穩進行家督相續掃清障礙；
在治理層面，本宗返回各地領地后，需承擔鎮守地方、安撫領民的職責，將本宗的力量轉化為維護地方穩定的助力，形成“家督集權、地方共治”的良性循環；
在情感層面，清定選擇“逐步推進”而非“一刀切”，安排本宗之中較為年長的次男先行就藩，既體現了對宗室的尊重，也為后續本宗之人就藩積累經驗，最大限度減少了上杉一族內部的抵觸情緒，避免了儲位之爭可能引發的朝堂動蕩。
一方面，清定上奏朝廷，繼續許可小笠原長定使用‘王’字的三階菱作為府中小笠原家的家紋，向世人表示府中小笠原家才是小笠原氏總領家；另一方面，他還將信濃安曇郡古廄城七千石加封給前任府中小笠原家家督小笠原長隆，讓其隱居料達到一萬四千石。
正所謂有人歡喜有人愁。
小笠原長定雖然無法覬覦上杉家世子之位，但至少擁有了信濃守護職、正五位上信濃守的官位，以及七萬五千石的知行地。
要知道，在上杉家中能領有七萬石以上知行地之人，除去主動臣服的大名、國人領主之外，大都是靠著一場場惡戰、血戰拼出來的。就算是一門親族眾筆頭上杉定虎，那也是為上杉家東征西討、南征北戰，這才得以繼承上杉家庶子家千秋上杉家的家名，領有二十二萬石知行地，并獲封從二位彈正尹的官位。
在上杉家結束近畿諸國戰事后領有七萬石以上知行地的，除去已經為足利義輝殉死的八條春綱，以及經略播磨一國陣亡的柿崎景家外，就只有上杉定虎、齋藤朝信、八條定繁、直江景綱、新發田長敦、山本寺定長、宇佐美定勝、甘糟景持、太田資正、長野業正等十余人。
這也是無可奈何之事。誰讓小笠原長定是上杉清定之子呢？
當然，清定為了避免小笠原長定在就藩之后受宵小、佞臣蠱惑，便指認二木重高、犬甘政德兩名府中小笠原家重臣擔任府中小笠原家宿老，從旁輔佐小笠原長定處理政務。同時，他還命鄰近府中小笠原領的長野業正來擔任小笠原長定的后見役。
隨著天野隆重慘敗于米子原的消息迅速傳遍出云一國后，神庭橫山城城主川井信濃守、三笠山城城主西村治右衛門、十神山城城主松田備前守等尼子家舊臣們紛紛向尼子復興軍主動開城投降。
而三澤城城主三澤為清、佐世城城主佐世清宗等人則是以收攏潰兵的名義率本部軍勢逃回了本領，并沒有與天野隆重一同南下逃往安藝。
即便多賀元龍勸說天野隆重應退回月山富田城后收攏敗軍進行堅守待援，可天野隆重卻并沒有采納，反而被尼子復興軍嚇破了膽，認為大勢已去，依舊決定逃回安藝。
就這樣，出云一國絕大部分地區先后易幟叛離了毛利家，尼子家也得以第二次恢復了家名。
但美中不足的是，作為組建尼子復興軍的核心人物河副久盛卻在米子原之戰中被一發流彈擊中后，還沒看到月山富田城光復，就傷重不治而亡。這就為尼子家的恢復家名蒙上了一層陰霾。